華大生命科學(xué)研究院攜手斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院、武漢大學(xué)電子信息學(xué)院等全球頂尖機(jī)構(gòu),近日取得重大科研進(jìn)展,其聯(lián)合研發(fā)的時(shí)空算法工具包Spateo在國(guó)際權(quán)威學(xué)術(shù)期刊《細(xì)胞》上發(fā)布,引起業(yè)界廣泛關(guān)注。
該研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)融合物理學(xué)、地理學(xué)及經(jīng)濟(jì)學(xué)等多個(gè)學(xué)科領(lǐng)域的數(shù)學(xué)模型,成功打造出這款名為Spateo的三維時(shí)空建模工具包。這一創(chuàng)新性工具不僅能夠高精度地重構(gòu)器官的三維結(jié)構(gòu),還能系統(tǒng)地量化其時(shí)空動(dòng)態(tài)變化過(guò)程。
Spateo工具包功能全面,提供了包括三維重建、區(qū)域數(shù)字化、細(xì)胞相互作用推斷等多項(xiàng)算法選擇,并配備了直觀的可視化界面,便于科研人員交互式操作。為驗(yàn)證其實(shí)用性,團(tuán)隊(duì)以小鼠胚胎和果蠅發(fā)育為例進(jìn)行了深入研究,成功構(gòu)建了小鼠胚胎發(fā)育的“3D分子全息圖”,揭示了器官在三維空間中隨時(shí)間變化的生態(tài)形成機(jī)制。
斯坦福醫(yī)學(xué)院的邱肖杰教授作為文章第一作者,對(duì)Spateo給予了高度評(píng)價(jià)。他認(rèn)為,這一工具包在創(chuàng)建預(yù)測(cè)性虛擬胚胎模型方面具有里程碑意義,其將生物系統(tǒng)視為相互連接的整體的視角,對(duì)于揭示先天性疾病的分子機(jī)制及推動(dòng)人類健康研究具有深遠(yuǎn)影響。
華大集團(tuán)表示,Spateo工具包的推出是時(shí)空組學(xué)研究領(lǐng)域的一大革命性突破,將為胚胎發(fā)育、腦科學(xué)、疾病研究等多個(gè)生命科學(xué)領(lǐng)域提供強(qiáng)大支持,為探索高精度時(shí)空生命全景觀奠定了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。